MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS5

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019432	AATA	2	8	2237	2244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019432	TAT	2	6	2275	2280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019432	CTTT	2	8	2387	2394	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019432	ATT	2	6	2430	2435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019432	T	6	6	2434	2439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019432	A	6	6	2447	2452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019432	T	6	6	2458	2463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019432	A	6	6	2476	2481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019432	T	6	6	2524	2529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019432	TCA	2	6	2539	2544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019432	CTT	2	6	2590	2595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019432	AC	3	6	3395	3400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019432	A	6	6	3452	3457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019432	TAA	2	6	5520	5525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019432	ATAA	2	8	5636	5643	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019432	A	6	6	6654	6659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019432	TA	3	6	6724	6729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019432	A	7	7	6735	6741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019432	T	6	6	6742	6747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019432	ATG	3	9	6788	6796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019432	AGA	3	9	6837	6845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019432	ATATA	2	10	6924	6933	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019432	TAT	2	6	6972	6977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019432	AATA	2	8	7002	7009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019432	AG	3	6	7061	7066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019432	A	6	6	7086	7091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019432	CAA	2	6	7143	7148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019432	CTA	2	6	7153	7158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019432	A	9	9	7187	7195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019432	TAG	2	6	7217	7222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019432	ACT	2	6	7236	7241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019432	T	7	7	7271	7277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019432	A	7	7	7286	7292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019432	ATA	2	6	7320	7325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019432	TCG	2	6	7335	7340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019432	TAG	2	6	7410	7415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019432	A	6	6	7488	7493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019432	TAG	2	6	7514	7519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019432	TTA	2	6	7614	7619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019432	A	6	6	7666	7671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019432	CTT	2	6	7709	7714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019432	TA	4	8	7784	7791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019432	T	7	7	7792	7798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019432	ATT	2	6	8407	8412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019432	ATC	2	6	8451	8456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019432	TCT	2	6	8536	8541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019432	CAA	2	6	8588	8593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019432	A	6	6	9208	9213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019432	T	6	6	9279	9284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019432	ACT	2	6	9670	9675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019432	GT	3	6	9729	9734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019432	AC	3	6	9735	9740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019432	AAT	2	6	9751	9756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019432	TCAC	2	8	9764	9771	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019432	ATTTT	2	10	9789	9798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019432	TATTTT	2	12	9816	9827	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019432	TGG	2	6	9828	9833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019432	A	7	7	9856	9862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019432	ATT	2	6	9880	9885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019432	AC	3	6	9918	9923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019432	T	7	7	9962	9968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019432	ATT	2	6	9980	9985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019432	TTC	2	6	9989	9994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019432	TCT	2	6	10029	10034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019432	T	7	7	10052	10058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019432	ATTT	2	8	10069	10076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019432	TTCT	2	8	10146	10153	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019432	TCATTG	2	12	10155	10166	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_019432	T	6	6	10168	10173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019432	T	6	6	10212	10217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019432	AAATT	2	10	10935	10944	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019432	TTA	2	6	10956	10961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019432	TAA	2	6	10977	10982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019432	ATAA	2	8	11052	11059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019432	TACA	2	8	11100	11107	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_019432	ATT	2	6	11143	11148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019432	TTCAA	2	10	11335	11344	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_019432	A	7	7	11385	11391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019432	A	7	7	11393	11399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019432	AT	4	8	11423	11430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019432	A	7	7	11456	11462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019432	A	7	7	11500	11506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019432	A	7	7	11522	11528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019432	A	7	7	11544	11550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019432	ATA	2	6	11598	11603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019432	GAA	2	6	11611	11616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019432	TTC	2	6	11635	11640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019432	AGG	2	6	11662	11667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.